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Blog - Sysmex Partec | Flow Cytometry Made in Germany
Vermeidung von ErtragsausfĂ€llen durch Aneuploidie â Schnelle Bestimmung der SaatgutqualitĂ€t im Labor Startseite â Aneuploide Samen können den Ertrag einer gesamten AnbauflĂ€che gefĂ€hrden. Mit dem CyFlowâą RP Ploidy Analyzer und dem CellTricsâą 50 ”m lĂ€sst sich die SaatgutqualitĂ€t schnell und prĂ€zise im Labor bestimmen â ohne aufwĂ€ndige Anzuchtversuche. Saatgut von Raps, Kohl und einer Reihe anderer Kulturpflanzen zeigt verhĂ€ltnismĂ€Ăig hĂ€ufig Chromosomenmutationen â sogenannte An-euploidie. Chargen mit hohem Anteil an solchem an-euploiden Saatgut sind unerwĂŒnscht und mĂŒssen identifiziert werden. Was ist An-euploidie? Definition An-euploidie An-euploidie wird definiert als der Verlust oder die Addition von ganzen Chromosomen im VerhĂ€ltnis zur ânormalenâ Chromosomenzahl. Betroffene Samen sind entweder nicht lebensfĂ€hig und keimen nicht aus â oder wachsen zu Pflanzen heran, die nicht die gewĂŒnschten Eigenschaften zeigen. Dies kann sich in KrĂŒppel- oder Zwergwuchs, SterilitĂ€t oder anderen Wachstumsstörungen zeigen, die sich negativ auf den Ertrag innerhalb einer AnbauflĂ€che auswirken. đ± Nicht lebensfĂ€hig / kein Keimen đȘŽ KrĂŒppel-, Zwergwuchs & SterilitĂ€t đ Negative Auswirkung auf den Ertrag Nachweis â konventionell und per DNA-Analytik Der direkte Nachweis von An-euploidie kann nur durch eine mikroskopische ZĂ€hlung der Chromosomen durchgefĂŒhrt werden. Notwendig dafĂŒr ist eine aufwĂ€ndige PrĂ€paration von bestimmten Zellen der wachsenden Wurzelspitze. In der Praxis der Saatgutproduktion ist dieser Test nicht durchfĂŒhrbar. Daher werden Testchargen des Saatguts ausgesĂ€t, um einerseits die KeimfĂ€higkeit zu testen und andererseits die AusprĂ€gung des PhĂ€notyps der heranwachsenden Pflanzen zu begutachten. HierĂŒber lassen sich RĂŒckschlĂŒsse auf die HĂ€ufigkeit von Chromosomenmutationen ziehen. Derartige Anzucht- und Wachstumsexperimente sind teuer und benötigen viel Zeit. Konventionell Anzucht & Wachstumsbeobachtung Testchargen werden ausgesĂ€t, KeimfĂ€higkeit geprĂŒft und der PhĂ€notyp heranwachsender Pflanzen begutachtet. RĂŒckschlĂŒsse auf Chromosomenmutationen sind möglich â aber der Weg ist aufwĂ€ndig. Wochen bis Monate Sysmex Partec DNA-Gehaltsquantifizierung Vergleich des zellulĂ€ren DNA-Gehalts von Samen mit normaler Chromosomenzahl mit Samen der zu untersuchenden Charge. Sysmex Partec hat diese Methode prĂ€gend mitentwickelt. Stunden statt Monate DNS-Histogramm einer Testpflanze mit einer Referenzpflanze Halb-automatisiert mit dem CyFlowâą RP Ploidy Analyzer Diese Analytik kann schnell an vielen Samen in einem halb-automatisierten Verfahren mit einem CyFlowâą RP Ploidy Analyzer durchgefĂŒhrt werden. Hierbei werden die Zellkerne jedes zu untersuchenden Samens in einem einfachen Verfahren zusammen mit einer Probe einer Referenzpflanze in Sysmex Partec CyStainâą Lösung extrahiert und mit einem fluoreszierenden Farbstoff markiert. CyFlowâą RP Ploidy Analyzer mit CyStainâą Reagenzien Die Rolle des CellTricsâą 50 ”m im Testverfahren Das entstandene Zellkerngemisch muss, bevor es in das CyFlowâą RP ĂŒberfĂŒhrt wird, von den bei der Extraktion entstandenen Fragmenten des Pflanzenmaterials befreit werden, da ansonsten das Risiko einer Verstopfung des AnalysegerĂ€tes besteht. HierfĂŒr eignen sich hervorragend die CellTricsâą Filter 50 ”m, die die Zellfragmente zurĂŒckhalten und eine Zellkernsuspension ohne störende Partikel produzieren. Eine wichtige Rolle im Testverfahren Direkt nach der Zellkernextraktion trennt der CellTricsâą Filter 50 ”m die relevanten Zellkerne zuverlĂ€ssig von störenden Partikeln in der Zellkernsuspension, so dass mögliche Probleme bei der anschlieĂenden Analyse verhindert werden â wie etwa Verstopfungen im Durchflusszytometer, die den Messablauf beeintrĂ€chtigen können. Die CellTricsâą Filter sind von Sysmex Partec entwickelt und besonders einfach zu handhaben. Sie lassen sich mĂŒhelos in jeden Workflow der Probenvorbereitung integrieren. Die patentierte Technologie ermöglicht eine Zelltrennung mit hoher Geschwindigkeit und ohne Druck, wodurch ZellschĂ€den minimiert und die Zellfunktion erhalten bleibt â die Grundlage fĂŒr prĂ€zise, reproduzierbare und konsistente Ergebnisse. 1 Schnellste Probefiltration durch sehr hohe Durchflussrate â ermöglicht durch die vertikal geneigte Filtergaze und integrierte BelĂŒftungsöffnung. 2 Dank zweier unterschiedlicher AuflageflĂ€chen sitzt der Filter sicher auf ProbengefĂ€Ăen verschiedener Durchmesser (2 ml â 15 ml). 3 Das 2 ml-Probenreservoir oberhalb der Filtergaze ermöglicht eine komfortable Filtration auch gröĂerer Volumina. CellTricsâą Filter 50 ”m (Artikelnr.: 04-0042-2317) Auswertung: Abweichungen im DNA-Gehalt sicher erkennen Die so gereinigten Zellkernproben können nun ohne Bedenken in das CyFlowâą RP eingesetzt und analysiert werden. Ăber den Vergleich der Messwerte von Referenz- und Testmaterial lassen sich nun Abweichungen im DNA-Gehalt der einzelnen getesteten Samen feststellen. Liegt eine solche absolute Abweichung ĂŒber einem zuvor bestimmten Grenzwert, wird der Samen als
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